본 발명은 부착조류시스템을 이용하여 농촌유역의 농배수로 또는 소하천수의 수질을 개선하는 방법에 관한 것으로서, 본 발명에 의한 방법은, 부착조류를 본 발명에 의한 부착조류시스템을 이용한 농촌유역 수질개선방법은, 영양물질 제거능력이 우수하며, 동시에 박테리아와 같은 미생물의 부착매질을 제공하는 생물막의 기능을 하고, 빠른 성장속도로 인해 수중 영양염에 대한 이용효율이 높은 사상성 부착조류의 장점을 최대한 발휘시킴으로써, 농촌지역의 농배수 또는 소하천수의 수질을 실질적인 효율로 개선할 수 있는 효과가 있다.